Аффлек сделал предложение Гарнер в день ее 33-летия. 

Они поженились 29 июня 2005 года на тайной церемонии на Карибских островах Теркс и Кайкос. Церемонию бракосочетания вел коллега актрисы по сериалу «Шпионка» актёр Виктор Гарбер и его супруг Райнер Андрисен. Замуж Дженнифер выходила беременной, 1 декабря у супругов родилась дочь Вайолет. 

Впрочем, кроме романтики такой выбор места прибавил и проблем: именно благодаря этому папарацци удалось сделать несколько нечетких свадебных снимков с яхты, находящейся напротив берега.

Кольцо Дженнифер Гарнер выполнено модным ювелирным домом Гарри Уинстона. Украшение с бриллиантом весом 4,5 карата оценивается в 500 000 долларов.