Больше половины татуировок Деппа была сделана нью-йоркским косметологом Джонатаном Шоу. Шоу можно увидеть в фильме Клинта Иствуда «Натянутый канат», где он играл мастера татуировки. На теле Джонни насчитывается 11 татуировок : 1)«Wino forever» на правом бицепсе Джонни. (Перебито из Winona, Вайнона Райдер - бывшая девушка) 2) Портрет коренного жителя (индейца чероки) Америки на правом бицепсе. В крови Джонни течёт индейская кровь. 3) Символ из «The brave» («Храбрец») на внутренней части правого предплечья Джонни. 4) Перевёрнутый треугольник на левом бицепсе Джонни 5) Надпись «Betty Sue» на левом бицепсе-в честь матери Джонни Бети Сью Палмер 6) Три маленьких прямоугольника на правом указательном пальце Джонни. Во многих ролях, Джонни будет носить большое кольцо, чтобы закрыть эту татуировку. 7) Номер 3, на левой руке Джонни, между его большим пальцем и указательным. 8) Череп и пересечённые кости с подписью «Death is Certain» (Смерть неизбежна) на внешней стороне нижней части ноги. 9) Маленький неизвестный символ на внутренней части правой лодыжки Джонни. 10) Надпись «Lily-Rose» в декоративном буквенном обозначении, застилизованая под имя Джонни. Эта тату в честь дочери Джонни. Её можно время от времени увидеть в «Карибских пиратах». 11) Надпись «Jack» и птица в полёте на правом предплечье в честь его сына.